Термичен цикъл: Термичният цикъл е основният компонент на PCR анализатора, който се използва за контрол на цикличната реакция на реакционния ензим и целевата проба при различни температури. Термичният цикъл може да постигне бърза промяна на температурата чрез елементи на Peltier или други технологии и да поддържа специфична температура във всеки цикъл. Термичният цикъл обикновено включва един или повече реакционни модули, всеки от които може независимо да контролира температурата и времето за постигане на едновременно откриване на множество проби.
Оптична система: Оптичната система се използва за откриване и измерване на флуоресцентния сигнал, генериран от PCR реакция. Оптичната система може да определи наличието и количеството на целта, като вълнува флуоресцентния маркер (като FAM, HEX или ROX) и открива неговата флуоресцентна интензивност. Оптичната система обикновено включва един или повече източници на възбуждане, като LED или лазерни светлини, и флуоресцентен детектор, като PMT (Photomultiplier Tube) или CCD (електронен чип за изображения).
Софтуерна система: Софтуерната система се използва за контрол на работата и анализа на данните на PCR анализатора. Като цяло софтуерната система на PCR анализатора може да зададе реакционните условия, да наблюдава напредъка на реакцията, да запише данните за реакцията и да анализира резултатите. Софтуерната система може да бъде свързана към PCR анализатора чрез USB, сериен порт или мрежа и предоставя графичен интерфейс и инструменти за анализ на данни.
Система за вземане на проби: Системата за вземане на проби се използва за зареждане и смесване на PCR реакционната система. Обикновено системата за вземане на проби може автоматично да зарежда проби и други съединения, като праймери и ензими, и да ги смесва и раздава, преди да започне реакцията. Системата за вземане на проби може да постигне зареждане и разпределяне на проби чрез тръби, спринцовки или други средства.
Система за верига: Системата на веригата се използва за контрол и наблюдение на работното състояние на PCR анализатора, включително температура, време, интензивност на флуоресценция и други параметри. Системата за верига може да бъде внедрена от микроконтролер, цифров сигнал процесор или други електронни компоненти.
Механична система: Механичната система се използва за преместване, регулиране и контрол на механичните части на PCR анализатора, като термичния цикъл, оптичната система и системата за вземане на проби. Механичната система може да бъде внедрена от система за предаване, задвижваща система и сензорна система.